Το σημερινό χωριό της Κουκουνάρας ή Κουκκουνάρας βρίσκεται περίπου 15 χλμ. βορειοανατολικά της Πύλου και διαθέτει πολλά νερά, καθώς τη διαρρέει το μικρό ποτάμι του Αράπη.
Στην ευρύτερη περιοχή εντοπίστηκαν και ανασκάφηκαν επτά θολωτοί τάφοι καθώς και κατάλοιπα μιας αρκετά διευρυμένης οικιστικής εγκατάστασης με μεγάλο πληθυσμό. Από τους τάφους αυτούς προήλθε πληθώρα ευρημάτων. Στη φυσική ακρόπολη στη θέση Καταρραχάκι, ένα περίπου χλμ ανατολικά του χωριού Κουκουνάρα, εντοπίστηκε μεγαροειδής κατασκευή ακανόνιστου σχήματος, αλλά επίσης, προς το χωριό Χανδρινού, εντοπίστηκε μεγάλο και πολυσύνθετο οίκημα, στον τύπο του μεγάρου.
Η Κουκουνάρα θεωρείται πως ερημώθηκε εξαιτίας κάποιου καταστροφικού γεγονότος.